巴拿馬運河管理局宣佈，為因應預期延長的聖嬰現象所帶來的嚴重乾旱，將從 9 月初開始限制每日船舶通行數量，此舉推翻了先前不限制通行的承諾。

根據巴拿馬運河管理局於 8 月 20 日（週四）發布的公告，這條連線大西洋與太平洋的戰略水道將從 9 月 3 日起，將每日允許通行的船舶數量從目前的 36 艘減少至 34 艘。《日本時報》（The Japan Times）與《海峽時報》（The Straits Times）均報導了相同的數字。進一步的限制將在 9 月 15 日實施，屆時每日通行量將再降至 32 艘。《金融時報》（Financial Times）指出，這是運河管理局史上第 2 次減少通行數量。

此次限制措施的後臺是聖嬰現象預期將在該地區造成更長時間的乾旱。半島電視臺報導，聖嬰天氣現象預計將增加該地區乾旱與極端高溫的可能。衛報（Guardian World）美洲版（The Guardian US）指出，中美洲正受嚴重乾旱影響，而聖嬰現象加劇了這場危機，可能導致運河航道面臨進一步限制。法國 24 西語（France 24 en Español）的報導則補充，聖嬰現象正強烈衝擊拉丁美洲，從墨西哥到智利都出現乾旱、洪水與極端氣溫，其中宏都拉斯、薩爾瓦多與尼加拉瓜的乾旱走廊受創最為嚴重，巴拿馬運河也因水位過低而宣佈減少運作。

巴拿馬運河管理局的決定，意味著其先前承諾不會限制船舶通行的立場出現轉變。南非媒體《每日異見者》（Daily Maverick）引述美聯社（AP）報導指出，運河管理局正為 1 個比往常更長的聖嬰季節做準備，該季節預期將降低水位，因此當局「推翻了先前不限制船舶通行的承諾」。越南媒體《青年報》（Thanh Niên）的報導也指出，聖嬰現象造成的嚴重缺水，迫使運河管理局「走回頭路」，宣佈將限制船舶通行。